如果已经办理了就不会处罚。行政处罚法规定做出行政处罚前应先责令改正违法行为,办理了许可证即是一个改正的过程和结果。在改正的情况下一般不再处罚。做为食品经营者应时刻以食品安全为己任,心中有法,时刻对法律有敬畏之心,法律将是你的守护者。