普通本三的老师一般是本二学校签约的老师，就是说你要同时教本二和本三的学生。但是如果和独立学院签约的话，那么一般就没有去本二教书的机会。
如果你是搞研究和教学同时进行的话，建议去更好的大学，研究理念设施经费都会好一点。如果是行政人员或者是只做讲师，区别就不明显。
另外待遇可能有差别，但同样在好的学校里竞争大晋升也是相对慢的。
只是参考意见，你多向学校了解一下情况，结合一下自己的情况再决定。
三本的老师似乎是企业编，不是事业编（我不完全肯定这一点）
如果求稳定而且去二本学校的希望不小的话，尽量去二本吧
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