1905年,清朝废除科举,割断儒学与利益分配的联系,儒家失去制度上的支持,只能以文化传统的余绪,绵延下去。清末民初,中国一再失败,知识分子开始相信中国文化已经崩坏,儒家也受到猛烈抨击,被认为是罪魁祸首,应为专制落后、贫穷疾病,以至裹小脚等各种弊病负责。辛亥革命之后,儒家建制迅速崩溃,儒学失去具体的托身之所,捍卫儒家思想的人,结果也是摧毁了儒家思想。袁世凯把儒家封为“国教”,使他登极的野心合法化,严重打击儒家声誉;孙传芳、张宗昌等军阀为了抬高自己的声望,也提倡儒家,进一步挫伤中国人对儒家的认同,儒家文化象征受滥用,使知识分子对儒家更为绝望。儒家在新文化运动中首当其冲,成为反传统的主要对象,被视为民主和科学的敌人。随着新式学堂取代科举,儒家经典越来越没有人读。民国初年,中小学堂的修身和国文课程,仍采用经训和孔子言行;五四运动以后,教育界主流视读经为大忌,教育内容中,儒家思想所占比重越来越轻,以至完全消失。一般人平时接触不到儒家,耳濡目染的也多是批评,儒家源泉在社群中有枯竭之象。1920年代以来,反孔运动与民族主义结合,多次涌现,儒家传统的衰败无可避免。至于解放后就更别提了。
西方文明的资本主义和共产主义民主平等的进步思想带给国人对自我的反省及对世界的认知和探索,而开始摆脱狭隘的陈旧的封建主义思想(这当然也包括儒家思想),而进入更广阔的天地。