你单位的利润总额是亏损的,但是做了所得税汇算的调整以后还亏损吗?如果不亏损了就需要缴税的。如果调整后需要缴税小于你交的3000元,就不用再交了。如果调整后需要缴税大于3000元,还需要补缴。如果调整后还是亏损,也是要调整的,说明你不需要缴税,已经交的税应该是给退税的。
目前税款上缴国库后一般是不退的。留抵的话,将来抵税款时,税务局要查账的。建议调整后应纳税所得额大于15000元小于15500元。这样你们需补缴100元。可免去很多麻烦。