分为疏水性氨基酸和亲水性氨基酸。亮氨酸、异亮氨酸、缬氨酸因为带有较长的疏水性侧链,所以属于疏水性氨基酸。苯丙氨酸、色氨酸因为侧链带有苯环,因而属于疏水性氨基酸。苏氨酸、丝氨酸因为侧链带有羟基基团,所以属于亲水性氨基酸。