（1） 从提供养分角度讲：有机肥、化肥（单元素肥料、专用肥、复合肥）自身含有一定养分，可以直接供给农作物吸收利用，而生物肥主要是通过微生物的生命活动，以提高其它肥料利用率来达到肥效；
（2） 从养分含量角度讲：化肥养分含量高，有机肥含量低，而生物肥基本不含养分或微含养分；
（3） 从肥效角度讲：化肥见效快但作用时间短，养分利用率低，有机肥见效相对较慢但作用时间长，养分利用率高。生物肥见效稍慢但作用时间长久，只要微生物活着就有效果，微生物活性越强肥效越高
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