合法。由于停薪留职人员不在单位领取工资，单位不需为职工缴存住房公积金。如职工本人在停薪留职期间要缴存住房公积金，应自行出资缴存。职工恢复在职工作后，单位应继续为其缴存住房公积金，但停薪留职期间的住房公积金单位资助部分单位不再补给。
要看你是怎样与单位签订停薪留职协议的。一般情况单位应该继续为停薪留职者缴纳养老保险，如果是在职人员，三险一金，个人和单位都得负担，个人和单位具体负担
合法
