A、水是由水分子构成的、氢分子构成氢气、氧分子构成氧气，水电解生成氢气和氧气，说明水中含有氢元素和氧氧元素，故A说法不正确．
B、决定元素种类的是原子的质子数即核电荷数，同种元素的原子的质子数或说核电荷数一定相同，不同元素的原子的核电荷数或说质子数一定不同，B说法正确．
C、同种元素的原子质子数不一定等于中子数，如有一种氢原子质子数为1，中子数为0，故C说法不正确．
D、在化学变化中原子是构成物质的最小粒子，但用物理方法原子可再分为中子、质子和电子，所以原子不是构成物质的最小粒子，D说法不正确．
故答案选B．
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