口袋红蓝绿，这三个版本的剧情是一模一样～后来在game boy colour上运行会出现对应版本的单调颜色，也就是说口袋绿所有东西都是绿色，只有深浅之分，同理对应另外几个版本。个人感觉挺坑爹，也许官方并未出这种版本【我懒得去考证，你们看看就算了】，只不过那时候大家玩的都是盗版的罢了～这大概在2000年之前。
后来有个特殊的口袋黄，因为之前版本红绿蓝与动画《宠物小精灵》并不是太吻合，所以出了这个版本～该版本在剧情上虽然跟红绿蓝版本大致相同，但很多细节上高度还原动画原著～比如主角一开始只有比卡丘，而且它讨厌呆在精灵球而一直跟在你屁股后面，大反派也修改为火箭队那俩人，所带宠物也是一样，修改了部分宠物的获取，使主角跟动画一样，可以同时拥有杰尼龟，小火龙，妙娃种子。修改了部分宠物模型，使其更像动画里的样子～当然同时修改了经验获取速度，增加了难度。【楼下有说是因为庆祝动画版上映才出的口袋黄，具体是为了动画出游戏，还是为了游戏出动画，我也懒得考证，你们了解一下就行了。】
之后又出现了口袋金银和水晶，该版本的改动相当大，除了剧情重做之外，而且加入了二周目，而二周目的地图就是口袋红黄蓝绿的地图。界面重做，新加了很多宠物，然而同期的口袋水晶宠物出场会有动画，比如比比鸟的翅膀会扇两下。总之很多很多的改动，比如加入了种树系统。我觉得应该称其为口袋妖怪2。金银之间的唯一区别在于最后的终极宠物，一个是火系的金鸟一个是水系的银鸟。【水晶是否是正统续作我也懒得考证，反正BUG一堆，比如无限捡神奇糖果，你们了解下就行了】
之后的版本，比如叶绿火红深蓝，蓝宝石绿宝石红宝石还有几个版本我就没再系统的玩过，不过貌似都差不多。【这里补充一下，老任的套路就是出了新的掌机后，总会出一个新掌机对应的新口袋妖怪版本，然后再出一个之前老版本对应新机型的画面翻新版复刻】
后来还有很多版本，比如心金和魂银，我就压根没玩过了。但口袋妖怪这东西，除了加宠物改剧情之外，改动不会特别大。【这里补充一下，心金和魂银就是在新机型上对老版本的金和银进行的画面翻新版的复刻，因为我个人比较推荐玩金银，所以，如果想要接触这款系列游戏的话，我推荐从画面比较优秀的心金和魂银开始，之前的老版本就不用接触了】
最新的就要算是口袋黑白两个版本了，已经出了2代。因为掌机的发展，加入了触屏和wifi网络，玩法更加多样化，界面也更加友好，宠物当然都已经达到了439个。【补充一下，在黑2白2之后，又陆续出了X和Y，始源蓝宝石和终极红宝石（复刻），日和月，究极日和究极月，最后到目前2021年为止是剑和盾，对应的掌机也换了两代了。】
要论好玩，肯定最新版本黑、白或者黑2、白2好玩，但说实话，复杂程度已经远比第一代红黄蓝绿高出很多，相比之下，什么宠物性格，个体值，努力值等高端数据已经不是我这样的休闲老玩家可以接受得了。另外值得一提的是，不只是黑、白和黑2、白2，之前某个版本开始就引入了3D模式，当然视角还是固定的俯视，但已经有了3D的感觉。【这段回答我改一下吧，因为掌机的性能在变化，所以，肯定是越高的版本越有意思，毕竟画面就已经提升了一大截了，至于个体值努力值性格等属性的介绍，在知道上我做过一个专门的回答，解释的很清楚，大家可以去看看。另外我之前所提的所谓的3D模式，只是平面立体感而已，并非3DS掌机的裸眼3D效果，宝可梦系列在3DS上并未真正的加入实时的裸眼3D效果，也仅仅是在战斗画面中应用了而已，这就已经导致游戏掉帧很厉害了，其实说白了，老任对宝可梦的优化其实做的很差，即使是到最新的版本剑和盾，被人诟病的对战技能动画——隔空打牛的效果也依然懒得做更改。】
总之，如果你不是个很职业的玩家我倒不建议你玩黑白，如果你是第一次接触，建议你可以先从金、银或者心金、魂银开始入手，因为之后都是在此基础上开始加可玩的元素，这样更有利于上手。【金和银，心金和魂银是我认为最有意思的版本，既然心金和魂银是优秀的复刻，有了画面提升，所以我也建议没有接触过本游戏的玩家可以心金魂银这里开始。】
作为一个红绿蓝的老玩家，现在已经工作好多年，比不上小学时那充足的时间和强大的记忆力和耐心……想当初红绿蓝我打通了无数次遍，即使没有啥可玩的我还是硬生生的把我的主流五只宠物全部练到了100级。那些现在的高端玩家是永远体会不到当初上六年级的我因为玩口袋蓝抓不到小火龙的郁闷的~那时候都想过要不要再买一个Game Boy来链接传送一下宠物。最起码能让鬼斯通进化成耿鬼。【让人不可思议的是，我在2015年购买了一台3DS的掌机，那时候我已经快30岁了，于是我重新捡起了这段回忆，并且变成了我之前口中的高端玩家（雾），就算是在今天2021年，我偶尔会玩玩，我真的非常喜爱这个游戏。】
对了，毕竟金银是十几年前的东西了，现在能不能找到还是个问题。【可以找到，各大模 拟 器里有，而且现在已经有了3DS 模 拟 器，你只需要找找资源，就可以玩到最新到究极日月的版本，干货的话：小 ， 鸡 ， 模 ， 拟 ， 器可以玩到黑2白2，3DS模拟器你们可以去 光 ， 环 ， 助 ， 手里找，那里面有一款改版的究极日，可以直接下载，但是因为是改版，可以获取所有宝可梦，对新手来说难度很大（就算是我通关时也有一点点运气成分，小心劝退），不是打 广 告，我只是个普通玩家，给你们指个路……switch的模拟器好像还没出？当然了，如果你真的热爱这个游戏，可以去购买掌机支持正版。】
---------------------以下是2022年6月11日补充------------------
这两天正在研究switch模拟器，我真超喜欢这游戏，但是作为中年玩家上有老下有小，买台机子不太现实，所以只能这样了。
模拟器比我想象的发展的要快多了，一款掌机出现，大概过个2、3年模拟器就能研发出来。
玩剑盾，电脑上用yuzu模拟器，手机上用蛋蛋。
先说明一下，不论用哪个模拟器，对机器的要求还是很高的。我1050ti的显卡玩yuzu模拟器，不论怎么设置，也都是15-20帧左右的样子，一点都不丝滑。蛋蛋模拟器倒是好很多，我手机是骁龙865的处理器，是蛋蛋官方说玩剑盾最低要求的CPU，玩起来平均25-30帧，但是手机发热很厉害。
虽然我是真爱，但帧数低的实在是受不了，所以建议大家还是先不要尝试了。
纯手工打字，希望采纳~
另外补充一下，楼上有提到高度还原动画的口袋妖怪版本。确实只有口袋黄是高度还原动画的，绿红蓝包括后来的叶绿火红深蓝都不是的~
楼上那位仁兄说的差不多了，再详细给你说一下区别吧
口袋妖怪系列游戏的正统作品一共分六个世代，每个世代都有若干作品，并且跟上一个世代的作品相比，精灵种类增多、游戏设定变复杂、增加新的道具、技能和特性：
第一世代：共151种精灵，包括红、黄、蓝、绿四个版本，四者剧情几乎相同，能抓到的怪的种类有差异。游戏平台为GB。
第二世代：251种精灵，加入了时间变化、昼夜变化和天气系统，有金、银、水晶三版，三者剧情几乎相同，能抓到的怪的种类有差异。游戏平台为GBC。
第三世代：386种精灵，加入了精灵特性系统和树果种植系统，有红宝石、蓝宝石、绿宝石三版，三者剧情几乎相同，能抓到的怪的种类有差异。此外还有火红、叶绿，为原来的红、绿的重制版本，剧情与红、绿几乎相同，但精灵数量和游戏系统等方面属于第三世代。游戏平台为GBA。
第四世代：493种精灵，增加了挖掘系统，有珍珠、钻石、白金三版，三者剧情几乎相同，能抓到的怪的种类有差异。另外还有金、银的重制版心金、魂银。游戏平台为NDS。
第五世代：649种精灵，加入了季节变化系统，有黑、白、黑2、白2四版，黑白是一对，黑2白2是一对，每一对的剧情是一样的，同样只是在能抓到的精灵上有差别。游戏平台为NDS。
第六世代：有X、Y两版，还未发售。游戏平台是3DS。
楼主如果是初次接触这个游戏的话，推荐白金/心金魂银/黑白/黑2白2这几作，没有掌机的话需要使用NDS模拟器。
如果楼主是因为口袋系列动画片才对游戏产生兴趣的话，推荐火红和叶绿，这两作剧情与动画第一部相同。不过既然楼下给更正了，那我也更正一下吧，跟动画完全相同的只有黄版，因为这个版本当时是为了同时促进动画的收视和游戏的销量而发售的。但是黄版的画面和游戏性现在看来都不行了，所以没有推荐。火红和叶绿与动画虽不完全相同但基本是一致的。
如果是从未接触过口袋妖怪的话推荐玩口袋妖怪心金（魂银），这两个是很成熟的正统作品，汉化及补丁都做得很好，而且心金魂银的地图最大，耐玩性强，系统操作也容易
最新的正统作品是口袋妖怪黑2白2
GB系列画质比较粗糙，而且出现的妖怪少。由于时代的原因，已经很少人玩
GB系列有口袋妖怪红、口袋妖怪蓝、口袋妖怪绿、口袋妖怪黄
(这四个是关东地图，是口袋妖怪系列的最初的四个，出现的口袋妖怪编号是001~151)
口袋妖怪银、口袋妖怪金、口袋妖怪水晶
(成都地图，出现的口袋妖怪编号是001~251）
GBA系列是口袋妖怪的发展加速时期，比起以前改进了很多。出现的口袋妖怪编号均为001~386
口袋妖怪红宝石、蓝宝石、绿宝石（以芳缘大陆为地图）
口袋妖怪火红、叶绿（这两个是GB系列红、绿的改进版）
NDS系列的口袋妖怪更清晰地分开了物攻和特攻，是最成熟的系列。
口袋妖怪珍珠、口袋妖怪钻石 、口袋妖怪白金 （以神奥大陆为地图，出现编号是001~493）
口袋妖怪心金 、口袋妖怪魂银 （这两个是GB系列金银的改进版）
口袋妖怪黑、白（以合众地区为地图，出现编号001~649）
口袋妖怪黑2、白2 （同样以合众地区为地图，是黑白版的后续故事，比起黑白多了更多的剧情，单机可获得的精灵也更多）
护林员系列和迷宫系列不是正统作品，玩的方式也不一样
护林员系列主要是用陀螺驯服精灵并用其解决问题，精灵不能像上面的正统作品那样训练强化
迷宫系列的主角是精灵，主要玩法是走迷宫，精灵可以训练强化
护林员系列有：口袋妖怪守护者、口袋妖怪守护者2-融合、口袋妖怪守护者3 - 光之轨迹
迷宫系列有：
口袋妖怪赤之救助队、口袋妖怪青之救助队、口袋妖怪空之探险队、暗之探险队、时之探险队
还有刚出不久的口袋妖怪 --马格纳之门和无限大迷宫，但这个是3DS平台，不能用模拟器玩...
另外还有口袋妖怪信长之野望 口袋妖怪 - 冲刺 口袋妖怪弹珠台等NDS 作品
口袋妖怪最开始的话是宝可梦红绿蓝三版本，初始御三家小火龙、妙蛙种子、杰尼龟。
第二世代的话是宝可梦金•银，水晶版，初始御三家是火球鼠、菊草叶、小锯鳄。
第三世代的话是比较熟知的宝可梦火红、宝可梦叶绿、宝可梦蓝宝石•红宝石、宝可梦绿宝石。也是很多自制改版的基础版本，这些版本初始御三家是火稚鸡、木守宫、水跃鱼。
第四世代的话是宝可梦钻石•珍珠,宝可梦白金,宝可梦心金•魂银，初始御三家是小火焰猴、草苗龟、波加曼，第四世代的话也是从GBA游戏改为NDS游戏，也是从2D进阶为3D。
第五世代的话是宝可梦黑•白和宝可梦黑2•白2，初始御三家是暖暖猪、藤藤蛇、水水獭。
第六世代的话是宝可梦X•Y和宝可梦欧米伽红宝石•阿尔法蓝宝石这是宝可梦红宝石•蓝宝石的复刻版，初始御三家是火狐狸、哈力栗、呱呱泡蛙。
第七世代的话是宝可梦太阳•月亮、宝可梦究极之日•究极之月、宝可梦Let's GO!皮卡丘/Let's GO!伊布，初始御三家为火斑喵、木木枭、球球海狮
第八世代的话是宝可梦剑•盾、宝可梦晶灿钻石•明亮珍珠、宝可梦传说:阿尔宙斯，初始御三家为炎兔儿、敲音猴、泪眼蜥。
第九世代目前还未全球同步发售，可知名称为宝可梦朱•紫，初始御三家为呆火鳄、新叶喵、润水鸭。
如果你要玩2D游戏那么推荐你玩宝可梦绿宝石，3D的话推荐你玩阿尔宙斯，都是比较全面的版本。
你好，依次解答（只说掌机正统续作）：
GB：口袋妖怪 红、黄、蓝、绿
GBC：口袋妖怪 金、银、水晶
GBA：口袋妖怪 红宝石、蓝宝石、绿宝石、火红、叶绿
NDS：口袋妖怪 珍珠、钻石、白金、心灵之金、灵魂之银、黑白、黑白2
3DS：口袋妖怪 XY（未发售）
最好玩的我觉得GBA的是绿宝石，NDS的是白金。
区别在于剧情不同、故事地点不同、精灵种类不同等。
其他列如：口袋妖怪 冲刺、方块、打字版、探险队、守护者等的非正统续作也很有意思~
希望我的回答能帮到你。
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