2000年6月，红旗商场批发公司在曹世如的带领下，脱离红旗商场实施改制，单独组建了民营的红旗连锁有限公司。
2002年3月，红旗连锁有限公司成功注册了相关类别的“红旗”商标。同时被评为成都市著名商标、四川省著名商标。
2004年5月，红旗连锁有限公司向成都红旗商场集团有限公司发出律师函，要求其停止对“红旗”商标的侵权行为，并针对其商标侵权行为提出经济赔偿。红旗连锁向供货商发出的通告称，“红旗连锁是‘红旗’商标惟一合法的使用者”。曹世如强硬表示，“成都商场只能有一面‘红旗’，使用商标不是看历史形成，而应该尊重法律。”
2005年3月，红旗连锁有限公司通过曲线方式收购了成都红旗商场（集团）有限公司。
2010年5月20日，成都红旗连锁股份有限公司正式创立。
2012年4月，红旗连锁网购商城将上线
2012年4月23日红旗连锁网购商城正式上线。
2012年9月5日，红旗连锁在深交所挂牌上市！
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