首先，理解你说的情况。
但是据我所知，只要仔细感觉，小心拖动文字框，还是比较容易对齐的。onenote中文字框位置并不是完全任意的。你缓慢仔细拖动一下，去感觉，应该能发现这些文字框是一个格子一个格子地移动的。既然是以一个汉字字符宽度为基本单位来定位的，那么所以你可以最小按一个汉字字符宽度来移动文字框。故而可以较为容易地对齐的。
多说无益，文字表述可能还让楼主迷惑，还是建议楼主缓慢移动一个文字框，仔细感觉一下，其实onenote中文字框是类似桌面图标的“网格对齐”的。
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