公司以规章制度为由扣发工资是违法行为，该规章制度无效。员工可以到当地劳动部门投诉、举报，要求依法对公司作出处理。
判断“公司乱定规章制度扣钱”的唯一标准，就是该规章制度是否经过职代会审议通过，且宣贯至每一位员工。否则，就是违法的，涉嫌乱扣工资。
法律依据请参阅《劳动合同法》的如下规定：
第四条 用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。
用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。
用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
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