学校哪个部门管理户口迁移证？

保卫处户籍室管理户口迁移证。
新生迁入户口：
1．新生可自愿凭入学通知书到当地公安机关将户口迁移到学校；
2．新生报到时凭《入学通知书》和学杂费交费收据到保卫处报到点交户口迁移证，每生交身份证办证费20元；
3．在学校身份证照相点照相；
4．依保卫处通知统一由各学院或各班班长到保卫处户籍室领取新身份证；
5．领取新证必须交回旧身份证。

每个学校的部门设置是不一样的，我们学校管理学生户口的部门是 保卫处 户籍科

但是据你的描述，我同意楼上的观点，你的户口现在应该是在人才市场，你应该去人才市场找你的户口，我在大学是做班长的，毕业时，同学们的这些材料都是经过我手的，据我的经验，你的户口就应该在人才市场。
或者你如果还有你所在学校的联系方式，比如能联系到你的导员，先打电话问他一下。或者在你们学校网站上找一下保卫处的联系电话，先问问，免得来回跑。再或者，你可以在网上找到你档案所在的那个人才市场的网站，查到他们的联系方式，打个电话问一下，就明白了。

一般是由学校保卫处户籍室统一办理户籍迁出手续 ，毕业前到学校保卫处户籍室领取《户口迁移证》。

你的户口应该在人才市场。建议你找学校毕业生办公室，问清情况。有没有给你落好，落哪里了。然后带上毕业证件，身份证件去办理。

去人才市场。