如果你的房屋是在政府作出规划公告（拆迁令）发布前建设的话，土地和房屋应该都能得到补偿，标准与同一地区类似地块房地产价格相同。如果是拆迁令公布以后盖的，那就是属于违法建筑，但有一点你可以向政府说明，既然不准建房，为什么发国有土地使用证？还是商业出让型（一般用于商业开发，如盖商品房或企业厂房）？我估计你的问题只是在于不能办房产证了，但不影响以后补偿。今年1月21日国务院颁布的《国有土地上房屋征收与补偿条例》中对像你这种情况有相关条款说明，也就是说你这种情况补偿是有法律依据的。
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