进项税额抵扣处理的是公司与国家（税务局）的关系，记入实收资本处理的是公司与股东（投资者）的关系。
进项税额是投资者已交的款项，但是以后会被企业销项税额抵扣掉的，那时进项税额就成了企业的钱，但其实这钱是投资者的，只是让企业给抵扣回来了，所以，抵扣回来的进项税额的钱还是投资者的，直接计入投资者的投入资本了。
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借：固定资产
应缴税费—应交增值税（进项税）
贷：实收资本
例如，人家给你100万，你把这一百万用来购买固定资产了。
借：银行存款
贷：实收资本；
借：固定资产
应缴税费—应交增值税（进项税）
贷：银行存款
你把银行存款这个中间环节去掉试试看
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