清朝康熙年间的陕西省西宁州就是现在的西宁市。
从明朝开始，西宁卫就隶属于陕西布政使司，西宁卫不仅管辖西宁及其附近地区，而且还控制着青海湖、柴达木及新疆南部的一些地区。到1488年又在西宁置抚治西宁兵备道，直接管辖蒙藏民族事务和负责西宁卫的军事防务。
1645年清军进入西宁。清朝初年西宁行政建制仍沿袭明朝，1725年改西宁卫为西宁府，辖西宁、碾伯二县及大通卫。西宁仍隶属于陕西省管辖。
到公元1829年，西宁县的辖地除今西宁市外，还包括今湟源、湟中、大通、互助、平安等，西宁一直处于河湟地区政治、经济、文化的中心和军事重镇的地位。
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