2011年9月，因为发现青蒿素——一种用于治疗疟疾的药物，挽救了全球特别是发展中国家的数百万人的生命。
这是中国科学家因为在中国本土进行的科学研究而首次获诺贝尔科学奖，是中国医学界迄今为止获得的最高奖项。理由为她发现了青蒿素，这种药品可以有效降低疟疾患者的死亡率。
屠呦呦致力于中医研究实践，带领团队攻坚克难，研究发现了青蒿素，为人类带来了一种全新结构的抗疟新药，解决了长期困扰的抗疟治疗失效难题，标志着人类抗疟步入新纪元。
以双氢青蒿素、青蒿琥酯等衍生物为基础的联合用药疗法（ACT）是国际抗疟第一用药，挽救了全球特别是发展中国家数百万人的生命，产生了巨大的经济社会效益，为中医药科技创新和人类健康事业作出了重要贡献。
屠呦呦获奖至少有4个方面的重大意义。 第一，是科研体制层面的。创新需要释放年轻人的能量。屠呦呦是生在旧中国，长在红旗下的一代。屠本人在39岁的时候参加了当时国家主持的『523任务』，担任青蒿素协作组的组长。放到现在，相当于39岁就担任了中国973重大专项的首席科学家，这是当下中国科学界完全不能想象的。文革时绝大部分的高年资科学家都被要求“靠边站”，这一反智做法的意外收获就是当年启用了大量的年轻人，其中的一部分年轻人如屠呦呦和张亭栋确实冲破了前辈的诸多思想障碍，在相对充足的科研资源的保证下做出了相当漂亮的科研成果。反观现在国内的科研体制（特别是90年代以后），对于年轻人（40岁以下）是真的不友好。科研资金的分配由老一辈说了算，每一次的科研基金申请本质上是各个科研大佬的利益交换和利益分配；年轻人回国后不管是不是独立PI，都要挂靠到各个大佬之下，否则就申请不到经费；又由于经费被大佬把持，年轻人的科研题目通常是大佬根据科研基金利益分配的具体内容来指定，而非年轻人自己决定。毫不客气地说，中国现在的科研体制本质上是寡头利益，老人政治和官僚主义的综合体，根本不给年轻人登上舞台的机会，想上舞台的唯一方法就是熬成未来的寡头；我国不论在科学还是经济上都尚处于追赶低位，承受不起这种智力和资源上的双重浪费。
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