解:定义在R上的偶函数f(x)满足f(x+1)=-f(x),可得f(x+2)=f(x),故函数为周期等于2的周期函数.再由函数在[-3,-2]上是减函数,可得函数在[2,3]上是增函数,根据周期性可得函数在[0,1]上是增函数.由于α,β是锐角三角形的两个角,可得α+β>π2,即α>π2-β,∴1>sinα>sin(π2-β)=cosβ>0,故有f(sinα)>f(cosβ),故选C.