你好，你的问题具体可以如下解决。
一，把你做该工程的资料全部找出来，包括支付员工的工资记录这些。这些就是你的证据。
二，用这些资料就可以到法院起诉了，这属于非法侵占。
另外，还要告诉大家一点，凡涉及到合作类的事项，金额较大的，还是要签订一个协议之类的东西，千万不要怕掉面子。以防万一啊。
你可以组织员工或者你手下的人去跟挂靠公司协商，也可以去找业主。农民工挂靠做项目很多，法律也认定事实，但前提你是违规，这种事情，你自己知道就行。
具体情况不明不好讲，关键要看你们协议约定如何、且有没有证据证明了，具体情况具体分析才行。
你挂靠别人的公司做工程又没有协议，打官司也赢不了，这就要告诉你必须要有自己的资质才可以成功。
要吸取这次教训，以后别这么做了，无凭无据对方坏了良心只能求合要回多少算多少。
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