单一窗口由当地政府电子口岸提供，软件免费，无服务；
九城系统由九城公司提供，软件免费，服务收费。
如果您熟悉报检业务，且所在单位的报检业务量不大，申报的风险小（就是通常不会被抽样检验或拦截），可以用单一窗口。
如果所在单位的业务有如下特点之一，建议使用九城系统：
（1）业务量大，对打单效率要求比较高；
（2）需要服务，尤其是报检时可能遇到局方系统故障、抽样检验或着被拦截等情况时；
（3）业务特殊，在申报时需要专业咨询才能完成全部申报流程的。
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