（一）资金保障问题
随着国民经济发展速度的不断加快，对公路建设与运输需求越来越高，特别是金融危机后我国政策力度在经济形势转变后出现了倾斜状况。现阶段，我国交通基础设计的建设还处于紧张阶段。从目前公路工程建设来看，工程建设规模不断扩大，造价提升，导致建设成本的极大提高，但现阶段银行信贷政策与地方融资政策的改变，地方、国内外经济组织正处于恢复期，致使严重限制了银行投资，减少了公路建设资金的来源渠道。
（二）城乡公路建设进度不均衡
我国地域广阔，进而增加了公路建设的难度，同时又受到施工条件、地方配置及资金等问题的限制。目前在交通运输经济建设中我国还存在较为严重的城乡差距。进一步完善公路网，可以有效缓解城乡的供需矛盾，实现城乡之间的互联互通，才能充分发挥路网的功能。但农村公路因其具有较低的技术标准、较差的路况质量及较低的自然灾害抵抗能力。导致城市与农村公路之间的差距越来越大，进而严重制约了公路网的完善和农村的发展。
（三）运输安全问题突出
随着交通运输量的日益增长，我国道路交通安全问题也得到了人们的广泛关注。随着社会经济发展速度的不断加快，要求道路运输必须提升其安全性，确保在乘客、货物空间位移次数与范围增加的同时，加大其安全保障措施。造成道路安全事故频发的主要原因包括以下几点：一是运输单位安全管理意识薄弱，安全制度不健全，对安全运输重视程度不足，无法真正做到安全行驶。二是客货运站安全管理不到位。作为运输安全管理的重要环节，客货运站安全管理如无法达到管理需求，将产生极为严重的后果。三是道路客货运输工作人员专业素质较低。现阶段，我国道路运输行业普遍存在客货运输工作人员素质较低的现象，主要体现在操作技能低，安全服务意识低等。在执行运输任务时部分驾驶人员存在违章操作、超载超速等行为，这些行为的大量出现，将大大增加事故发生的几率。
（四）道路运输外部性问题
“外部性”的经济意义是指一个经济主体的经济活动对另一个经济主体所产生的有害或有益的影响，也就是由于市场活动而给无辜的第三方造成的成本。在道路交通运输中，其具有较大的社会效益与经济效益。自20世纪以来，我国交通运输事业得到了快速的发展，与此同时，交通事故、交通拥堵、噪音污染、大气污染等状况越来越严重，这都对自然环境造成了极大的影响。特别是在城市生态化发展的基础下，交通运输产生的外部性成本越来越得到人们的重视。在交通运输减排工作中目前存在的主要问题包括运输结构合理性较低、代替燃料推广力度不足、车辆减排标准不完善等。这种情况下，在大力发展交通经济的同时，必须为其产生的外部性成本买单，这样将给道路运输经济的可持续发展造成极大的阻碍。
（五）抵抗自然灾害能力较低
根据相关数据显示，各地区在2010年上半年就突发事件报道中造成道路阻断的信息就有1660条，在总比例中最多的就是恶劣天气，总比例在80%。特别是第二季度，我国大范围集中降雨就发生了9次，暴雨下公路损坏情况各不相同，交通中断、受阻的道路中高速公路为28条、国道为15条、省道为10条以上。路基冲毁累计为11000公里，路面冲毁累计17000公里，桥梁损坏累计1425座，产生的坍塌位置就有67000处。相比2009年，2010年我国上半年公路因自然灾害损坏的数量就比2009年全年还多。
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