(1)设该企业2013年处理的餐厨垃圾x吨,建筑垃圾y吨,根据题意,得25x+16y=5200100x+30y=5200+8800,解得x=80y=200.答:该企业2013年处理的餐厨垃圾80吨,建筑垃圾200吨;(2)设该企业2014年处理的餐厨垃圾x吨,建筑垃圾y吨,需要支付这两种垃圾处理费共a元,根据题意得,x+y=240y≤3x,解得x≥60.a=100x+30y=100x+30(240-x)=70x+7200,由于a的值随x的增大而增大,所以当x=60时,a值最小,最小值=70×60+7200=11400(元).答:2014年该企业最少需要支付这两种垃圾处理费共11400元.