欠款纠纷与物权保护纠纷在法律上是两个案由,会作为两个不同案件,分案受理并审理,因此一般来说两个案件不影响。但是,若欠款纠纷与物权保护案件,针对的同一案件标的,就只能以一案受理并审理。如车辆买卖合同纠纷,针对车辆买卖发生欠款,那法院会以买卖合同纠纷立案并审理。