山西中医学院的前身为1978年创办的山西医学院中医大学班。并于1982年由国务院批准筹建。1989年6月,正式挂牌成立。1999年6月,学校通过了原国家教委本科教学工作合格评价。2001年,开始招收硕士研究生。2002年,开始招收留学生。 2007年4月,学校以“良好”的成绩通过了教育部本科教学工作水平评估。2013年,获批招收港澳台地区本科生。 2015年4月27日,该校入选 “卓越医生(中医)教育培养计划改革”试点高校,并承担“中医学五年制本科人才培养模式改革”试点项目1项。