发现各类常见微型动物主要为原生动物，纤毛虫也在所有水样中出现。绝大多数水样中有肉足虫纲，轮虫经常出现，但数量不多。线虫和红斑顠体虫偶尔出现，且数量稀少。褶累枝虫和彩盖虫主要出现在冬天，当时水温在15-18℃之间变化。球核甲变形虫、鞘居虫属、水虱伪独缩虫、红斑顠体虫主要出现在炎热高温的夏季。
在活性污泥系统中的所有动物种类中，褶累枝虫出现得最多，沟钟虫为最常见的钟虫，轮虫是活性污泥中最常见的后生动物,
全年出现在活性污泥系统中。
红斑顠体虫在水温超过28℃的6月至8月间出现较多，时常伴随着柱头虫、小毛板壳虫和锐利楯纤虫一同出现。
枝角类通称水蚤，俗称红虫，GL污水处理厂在4月由于设备故障，长时间无进水而间断曝气，水中藻类开始大量繁殖，红虫也开始大量繁殖。
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