霍青桐识破清军阴谋，大败清军。胜后，霍青桐带病出走，途遇关东三魔，险遭污辱，幸得师父天山双鹰赶到救出。陈家洛此时方知李沅芷女扮男装，后悔自己辜负了霍青桐的一片芳心，与香香公主一同追赶，途中先后遇见狼群和张召重、关东三鹰、霍青桐，众人为抗恶狼暂时联手。陈家洛用霍青桐赠送他的短剑杀狼时，碰巧解开了其中的秘密，遂和霍青桐、香香公主逃出狼群，躲入迷城古洞，并得了一套奇高的武功。
陈家洛师父袁士霄为消灭群狼，设置一土城，用牛、马等将狼群引入城中。陈家洛用新学武功打败张召重，将其投入狼群之中。其间余鱼同得知师父马真被张召重所害，脱下袈裟誓为师父报仇，李沅芷借其报仇心切，设计陆菲青从中撮合，二人终于订下终身。
陈家洛从师父处取得有关乾隆身世的秘证，南下福建少林寺，欲了解义父被逐出少林的原因，经过连场比试，凭借武功与机智，弄清了全部事实真相。
香香公主被擒，乾隆欲据为已有，陈家洛与乾隆相见，以国家利益为重，答应帮助劝说香香公主；香香公主含泪答应了陈家洛，后发现乾隆并不真想反清复明，遂自杀示警，陈家洛伤心之余，抱着最后一线希望进入皇宫，险被毒死。众英雄大开杀戒，天山双鹰与红花会十当家章进身亡，最后捉住乾隆。
霍青桐正欲杀之为父、兄、妹及族人报仇时，安徽巡抚方有德突然抱婴儿出现。原来他与侍卫火烧福建少林寺抢得周绮之子来京向乾隆报功。他以婴儿性命相威胁，众人不忍见婴儿死于非命，遂放弃杀乾隆之念，活捉乾隆之私生子福康安出宫，迫使乾隆不与红花会为难。众人赶至香香公主之坟，打开后只见一滩碧血，香香公主的尸体已化作一缕香魂，陈家洛挥毫题上《香冢》诗词，并作铭后凄然而去，与红花会众英雄前往西疆栖身。
乾隆那人背叛了当年和陈家洛的誓言。乾隆抓了鱼同夫妻，要杀红花会的人，但是被赵半山打回去，陈家洛说红花会没有贪生半死之辈，乾隆说就算他死了，太后找的下一个继承皇位的人会对汉人更严厉的。陈家洛在和红花会的商量后跟乾隆说，只要他能不论满汉，对百姓宽仁，不再频频发动战争，他们可以交换人质。因为陈家洛手上有福康安。乾隆答应了这个要求。双方交换人质。乾隆跟皇太后说他是爱新觉罗的子孙，以后会做好皇帝的。然后就全剧终了。
有些介绍说赵半山是朝廷派来的，后来杀害文泰来，可是在这个版本里他们都是衷心红花会的，到最后他们俩都活着。
那个结局我也不知道算啥意思，也没说在没在一起，加洛和青桐的最后一场对话，他们去赴“鸿门宴”的路上，两人骑着马，加洛说一切都不可能回到从前了什么的，青桐说对啊。我觉得这段对话有点蛛丝马迹吧，就靠自己感觉了……在没在一起……不同人不同的结论。
没说哦 都纠结死了，不是说乔版的陈家洛是专一的满
无论书剑的那个版本，都会按照金老爷子的原著都是“物是人非事事休”，陈家洛和霍青桐是不会在一起的
08版最后香香死了，皇帝在宫内摆了鸿门宴，红花会挟持了福康安出了宫，乾隆挟持李阮芷余鱼同与陈家洛交换，最后红花会众人离开，乾隆独自在宫内回忆之前点点滴滴，享受胜者的悲哀。。
这结局很汗，好像戏说乾隆一样~
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