电脑被恶意网站修改，在开机启动中加入了非法启动项，并修改了注册表所造成。
或者是计算机被人植入了木马程序，开机后即被运行所致。
也可能是因为直接或者间接地下载了一些不安全的插件，通常这类插件会利用浏览器的IE内核来调用IE窗口。
这有详细的解决办法
《流氓网站招招看 详细剖析恶意弹出窗口》
http://edu.itbulo.com/200609/105961_2.htm
http://www.skycn.com/soft/14441.html
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