如果把国产货物销售到国内的出口加工区，有进出口权的公司可以视同商品外销并申请退税吗？

是的，可以申请退税。

请参阅最新的财政部与国税总局联合发布的

财税[2012]39号

关于出口货物劳务增值税和消费税政策的通知

中的一（二）2内容

2.出口企业经海关报关进入国家批准的出口加工区、保税物流园区、保税港区、综合保税区、珠澳跨境工业区（珠海园区）、中哈霍尔果斯国际边境合作中心（中方配套区域）、保税物流中心（B型）（以下统称特殊区域）并销售给特殊区域内单位或境外单位、个人的货物。

对于外贸企业来说，用于出口退税的进项发票不能“一票两用”，即不能即用于抵扣又用于退税。 

政策如下：

1、原财税字(1995)92号(已废止)第八条规定： 外贸企业出口货物必须单独设帐核算购进金额和进项税额，如购进的货物当时不能确定是用于出口或内销的，一律记入出口库存帐，内销时必须从出口库存帐转入内销库存帐。征税机关可凭该批货物的专用发票或退税机关出具的证明办理抵扣。

2、财税(2012)39号：外贸企业应单独设账核算出口货物的购进金额和进项税额，若购进货物时不能确定是用于出口的，先记入出口库存账，用于其他用途时应从出口库存账转出。

外贸企业的进项发票，无外乎如下几种处理：

1、采购时就分清出口和内销了，则开进发票时分别开具，用于内销的认证后直接抵扣，用于出口的认证后不抵扣；

2、采购时不能分清或者虽然分清，但开进发票时未分开开具，即内外销的进货开在一张发票，则认证后暂时计入出口库存并不得抵扣，待出口后，再把内销部分开具《出口货物转内销证明》来进行抵扣； 

3、用于出口，取得发票时认证未抵扣，待出口后发现种种原因不但不能退税而且要视同内销，则开具《出口货物转内销证明》进行抵扣；

4、取得费用发票，如内陆运费、港杂费、报关费、海运费等专用发票。如果出口业务是可退税或免税不退税的，其进项不能抵扣，发票认证后不需要抵扣；如果出口业务是视同内销征税的，其进项可以抵扣，发票认证后直接抵扣即可。(注意：生产企业出口业务在退税或视同内销时，其所有进项都可以抵扣，免税时不能抵扣) 

外贸企业进项税额的填列方法： 用于出口退税的货物进项税在附表二的26、27、28栏显示。根据国税函20081075号： “本期已认证相符且本期未申报抵扣”，调整填写为本期认证相符，但因按照税法规定暂不予抵扣及按照税法规定不允许抵扣，而未申报抵扣的防伪税控增值税专用发票和机动车销售统一发票，包括外贸企业购进供出口的货物 “按照税法规定不允许抵扣”，填写期末已认证相符但未申报抵扣的防伪税控增值税专用发票和机动车销售统一发票中，按照税法规定不允许抵扣，而只能作为出口退税凭证或应列入成本、资产等项目的防伪税控增值税专用发票和机动车销售统一发票。包括外贸出口企业用于出口而采购货物的防伪税控增值税专用发票等。

填列规则： 25栏=上期27栏-28栏 26栏=本期认证但暂不抵扣或不抵扣的数据 27栏=25栏+26栏-本期转为抵扣的数据(即附表二第3栏数据) 28栏=本期正式申报退税的数据 (注：以上规则在有些地区不适用，注意不能一概而论,需要看各地区对申报表的设计规则) 例1：5月份取得进项发票3张，各1000元，进项税各170元，5月份正式申报退税1张。