基肥是用于幼苗生长，幼苗生长需要养分，但根系较弱，还未生长，不能从土壤中吸取生长所需，所以基肥能使幼苗快速壮大，提高抗病力。基肥要占总肥50%-60%左右，基肥建议施用复合肥和有机肥，一般每亩食用复合肥30kg左右，而腐熟的有机肥在2000kg左右。
种肥是在黄豆播种时随种子一起施下的肥料，主要是为了提高种子发芽提供养分，使其出苗顺利安全。施种肥时要注意避免种子和肥料直接接触，以免肥料对种子和幼芽造成烧苗现象，影响种子的出芽率。施肥时先将肥料施下，覆盖一层细土后再播种，这样在种子发芽后即可吸取养分，快速出苗
前期施肥以氮肥为主，磷肥为辅，氮肥可促进植株生长，能提早开花结荚，而磷肥可提高植株抗病力，使发病率降低，发病时病害较轻。而到了结荚期，要以磷钾肥为主，少施氮肥，这时植株已发育完成，对氮肥需求也不大，当结荚对磷钾肥需求较大。后期则应施加适量的有机肥，提供微量元素，实现高产、优产的目的。
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