A、同一生物个体不同细胞差异的根本原因是基因的选择性表达，即mRNA不同，A正确；B、同一生物个体不同细胞都是由同一个受精卵有丝分裂形成的，含有相同的DNA，B错误；C、蛋白质不同是同一生物个体不同细胞差异的直接原因，不是根本原因，C错误；D、所有细胞所含核糖核苷酸相同，D错误．故选：A．
