2000年，青田县辖10个镇、23个乡。 2002年1月，撤销腊口镇、石帆乡，设立新的腊口镇；撤销阜山乡、双垟乡、设立新的阜山乡。调整后，青田县下辖10个镇、21个乡，14个社区、9个居民区、436个行政村，分别为鹤城镇、温溪镇、东源镇、船寮镇、北山镇、山口镇、海口镇、高湖镇、腊口镇、仁庄镇；章村乡、舒桥乡、贵岙乡、石溪乡、祯埠乡、祯旺乡、万山乡、黄垟乡、季宅乡、海溪乡、小舟山乡、高市乡、巨浦乡、万阜乡、汤垟乡、方山乡、吴坑乡、仁宫乡、章旦乡、阜山乡、岭根乡。
2004年6月，青田县北山镇所辖行政村由30个减为21个，镇政府驻地由北山村迁至泉山村；岭根乡所辖行政村由12个减为5个，乡政府驻地由岭根村迁至黄驮山村井坪。 2012年，青田县实施撤镇建街道区划调整，撤消鹤城镇，设立鹤城、瓯南、油竹3个街道。调整后，青田县下辖3街道、9镇、21乡，414个行政村。
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