长呼吸链，NADH开始的，生成2.5个ATP。
短呼吸链，FADH2开始的，生成1.5个ATP。
至于穿梭机制，是考虑到NADH在哪里生成的。如果是无氧呼吸，在胞液生成的NADH，由于NADH自己不能自由穿梭于线粒体膜，所以需要借助其他物质。有两种穿梭机制。一种是苹果酸穿梭，一种是α-磷酸甘油穿梭。苹果酸穿梭的方式，在线粒体内还是NADH，所以仍然是2.5个ATP。α-磷酸甘油穿梭，在线粒体内生成的是FADH2，就是1.5个ATP。
38ATP
柠檬酸循环（tricarboxylicacidcycle）：也称为三羧酸循环（tricarboxylic acid cycle，TCA循环，TAC），Krebs循环。是用于将乙酰CoA中的乙酰基氧化成二氧化碳和还原当量的酶促反应的循环系统
反应式：
Acetyl-CoA + 3 NAD + FAD + GDP + Pi + 2 H2O →CoA-SH + 3 NADH + 3 H + FADH2 + GTP + 2 CO2
以前的老版本是一个NADH经过呼吸链生成3个ATP，总共产生38ATP
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