厦深铁路起于厦门北站，终到深圳北站。全线共设车站20个，客运站18个，前场站和洋奎站不停客运。
从北到南依次为厦门北站，前场站，角美站，漳州站，洋奎站（预留），漳浦站，云霄站，诏安站，饶平站，潮汕站，潮阳站，普宁站，葵潭站，陆丰站，汕尾站，鲘门站，惠东站，惠州南站，深圳坪山站，深圳北站。
