A、在化学变化中,质子数不发生变化,则不能决定元素的化学性质,故A错误;B、在变化中,中子数不发生变化,不能决定元素的化学性质,故B错误;C、电子数的变化是由最外层电子数的变化引起的,电子数不能决定元素的化学性质,故C错误;D、在化学变化中,最外层电子数失去或得到电子,从而使元素具有不同的化学性质,则最外层电子数决定元素的化学性质,故D正确.故选D.