A．叶绿体、线粒体中遗传物质的遗传属于细胞质遗传，不遵循孟德尔遗传定律，A错误． B．由题干可知Y与y、R与r是两对位于非同源染色体上的等位基因，形成配子时等位基因彼此分享，非同源染色体上的非等位基因自由组合互不干扰，B正确． C．F1产生4种不同的雌雄配子，则表中③的基因型是4YyRr，②的基因型是2YYRr，④的基因型是2yyRr，①的基因型是1YYRR，故F2中出现的概率之间的关系为③：②=④：①，C正确． D．纯种亲本的基因型有两种YYRR、yyrr或YYrr、yyRR．因此F2中出现表现型不同于亲本的重组类型的比例是3/8或5/8，D正确．故答：A．
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