呵呵，很巧，我本科是北航读的，我女友是北师大的。所以算是对这两所学校有着一定的了解。
物理在北航属于9系理学院，说实话，这在北航这个以工科为主的院校是个不怎么受重视的院系，各方面的投入和关注都要小一些，教学和科研实力也就是一般般。
而北师大虽然这些年师范类专业不那么多了，但是毕竟曾经是以师范类为主打的院校，所以你要考的这个专业，实力方面绝对是北师>北航。
再分析难度。这两所都是34所自主划线学校。
北航去年分数线：http://yzb.buaa.edu.cn/11contents/11SSZS/recruit10-11fslqgzsm.htm
可以看到理学复试线是300,45,80；
北师大去年分数线：http://graduate.bnu.edu.cn/ReadNews.aspx?NewsId=110309032445
可以看到理学复试线是310,48,90.
所以说难度差距并不会很大。
综合说来，推荐选择报考北京师范大学。
如果有问题可以追问，我们继续交流。
如果只看学校，我会选北师大
看你将来更想从事哪一方面工作了，如果是科研类的话还是推荐北航
北航
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