请问,知道一个SNP的号,怎么知道它处于该基因的第几个外显子呢?

尝试过NCBI的SNP功能,但是没有找到啊。
2024-11-21 20:26:41
推荐回答(2个)
回答1:

如果该基因的外显子数目不多的话,直接可以通过snp的图形界面显示出来。

这里显示了rs334位于HBB基因的第一个外显子上。

回答2:

告诉你一个简单的方法,用包含此SNP位点的短序列进行Blast,查出包含此位点的上下游的序列。然后复制其上下游余约3K的序列(一般基因都小于6K,不行就再多复制一些序列),找一个基因预测的软件或网站(比如softberry)进行基因预测,然后你就知道这个SNP位点位于基因的第几个外显子 了。