求教高手!!基因组DNA电泳现象:电泳图分析一下(分布不均的原因,移动速率的影响因素)还有偶的结果

2024-12-04 20:46:58
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回答1:

你的这个电泳图基本上都可以看到主条带,从上往下第一条很清晰的条带就是基因组DNA,这条条带除了二号基本是比较完整而明亮的,做下游操作基本没啥问题。二号不是没有,而是量低了。四号和五号可以看到点样孔里面有些明亮的东西,这些是蛋白污染或者盐离子含量过高的特征,但从主要条带上看并没有影响到它们的迁移率,所以污染不是很严重。所有的样品主条带以下没有一个很明显的拖尾现象,证明DNA机械损伤并不严重。你后面那一片很亮的东西,其实不是DNA,应该是RNA。你做过RNA消化么?建议溶解DNA后,添加外源性的RNase,37度消化1小时左右做电泳。消化之后的DNA电泳就不会有下面那一片明亮的东西了。然后啊,实际上后面那一片RNA带其实对后续操作没有多少影响的,你可以不去管它,如果你要作图,那么建议消化RNA后再跑。最后一个问题,你跑基因组DNA不跑Marker的么?你最好跑一个hindIII digest marker或者类似的marker,因为琼脂糖凝胶只能分辨20kb以下的DNA片段,高于20kb的片段迁移率和20kb的marker迁移率是一致的。所以基因组DNA电泳使用一个拥有20kb左右条带的marker可以帮助你确定你的DNA纯度,因为蛋白污染严重的情况下蛋白会阻碍DNA迁移出胶孔的速率,使得DNA主条带出现在20kb以上,并且条带和孔之间会有一片拖带。这样能更好的确定DNA的质量。

回答2:

上样量太大了

其他感觉比较正常

跑的质粒?