厦门万石植物园不在鼓浪屿。
厦门万石植物园一般指厦门园林植物园。
厦门园林植物园地处厦门市中心，背靠五老峰南普陀寺、厦门大学，紧邻中山路商圈，占地4.93平方公里。距中山路约1公里；距轮渡码头约2公里；距厦门火车站约3公里；距高崎机场约15公里。
即下图中A地点
