2种可能：硬件或者软件：
硬件：只能是键盘按键原因，可能是按键里进东西了，可能是按键的弹性不好了，也可能是按键的电路出现问题，一般为矩阵出现问题较多；
软件：正如你所说搜狗拼音输入法经常会连带关联设置向导，如果设置不对了，极有可能是和你PC机中的其他软件不兼容冲突了，或者屏蔽的一些正常功能，注册表也有可能没有清理干净。我原来遇到过软件的问题，也是搜狗拼音输入法的问题；
总结：通常在排除键盘的问题情况下，软件的可能性就很大了。要综合考虑，一个一个排除。
您查找问题的方法很好，一步一步排除，先找一键盘试，排除是不是键盘问题；或者先重新装输入法也可切换输入法，排除软件故障，还有就是插孔检查别小视或者忽视，这也可能引起，USB有问题的话，可以换个口试试
应该是你卸载的不够完整，导致两个输入法冲突引起的
启动到安全模式也是这样么
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