B外贸公司直接付佣金给C货代的，也就是说A工厂和C货代没有直接联系的。
客人货款打到B外贸公司的，B将这一票单子产生的费用明细列好由工厂付款给外贸公司，也可在货款中直接扣除。B应该不用交税。
我们公司遇到过这种情况，帮别人出口的，我的回答仅供参考。
第一：A公司是不是生产厂家？如是，请看下文，
因为有B外贸公司代理进出口业务，所以A厂家需要支付出口的所有费用（FOB货CIF，根据和国外客人协商的交易条件，看具体事件而定）
B公司全权帮助A公司联系货代收货款等事务，并收取A公司的增值税发票负责退税，还有国外工厂的预付款，余款等。
C货代问B公司收取货物代理佣金
我知道的就那么多 希望能帮助你
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