是的。违反协议的相关约定，依照《合同法》的有关规定，肯定是要支付违约和中介公司的佣金的，因为中介公司作为居间方，没有存在过错，买卖双方佣金的支付都应该由违约方承担。
消费者通过中介买卖二手房，通常要签订如下三类合同：第一类是居间合同，一般情况下，居间合同在整个交易中最真实、最有效；第二类是买卖合同，即正式的商品房买卖合同或房屋买卖合同；第三类是辅助合同，包括担保合同、贷款合同、评估合同等等。其中居间合同就约定了买卖双方与中介方的责任关系。
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