1984年 创办工科混合班
1994年 设立工程教育高级班
1999年 设立创新与创业管理强化班(ITP)
2000年 竺可桢学院成立,增设文科实验班、理科实验班、金融学实验班
2004年 设立公共管理强化班(UPA)、竺可桢学院—计算机学院共建班
2005年 设立巴德年医学班、数学与应用数学英才班(丘成桐数学班)
2006年 设立文、理、工三大类平台
2008年 设立设计创新班(Innovation Design)、外语+X平台
2010年 设立求是科学班,重设混合班
2012年 设立启真班,暂时只此一届