以南方航空为例，飞机托运宠物办理手续流程如下：
1、旅客托运小动物，必须在定座时提出，至少应在航班起飞时间前72小时提出申请，经南航回复后方可托运；
2、个别小型飞机装载活体小动物行李总数不得超过三件，具体应根据南航机务工程部门给出的相关机型限制条件确定；
3、每名旅客只可托运一只小动物或一对鸟类动物（须符合有关承运人和出入境国家的规定）；每只托运的小动物应单独装入一个笼内；一对小鸟可装入同一个笼内；
4、旅客托运的活体动物笼体包装最大不能超过40x60x100厘米，最小不能小于5x15x20厘米，重量最大不得超过32公斤，应单独装笼；
5、如航班机型的货舱条件不适合运输活体动物，不能接受旅客申请办理小动物运输。地面工作人员在收运前应确认该航班机型是否适合运输小动物；
6、南航暂不接受活体小动物联程运输；
7、旅客携带的小动物必须是健康、无害、干净、无异味的，并且不能携带怀孕的小动物；
8、旅客应在乘机之日离站时间90分钟以前，将活体动物自行运至机场办理托运手续；
9、如旅客托运小动物为犬或猫，旅客须签署小动物运输免责书。
扩展资料
《公共航空运输企业航空安全保卫规则》中规定：
第四十七条 旅客办理乘机手续时，公共航空运输企业及其代理人应当采取措施核对乘机人的身份证件和行李。
第四十八条 公共航空运输企业应当制定程序，核对加入机组人员的身份证件、工作证件和乘机证明文件，确保人证相符。
第四十九条 旅客办理乘机手续时，公共航空运输企业及其代理人应当告知其相关安全保卫规定。
第五十三条 已经安全检查和未经安全检查的人员不得相混或接触。如发生相混或接触，公共航空运输企业应当要求机场管理机构采取以下措施：
（一）对相应隔离区进行清场和检查；
（二）对相应旅客及其手提行李再次进行安全检查；
（三）如果旅客已进入航空器，应当对该航空器客舱实施安保搜查。
第五十六条 对通过安全检查的托运行李，公共航空运输企业应当采取措施或要求机场管理机构采取措施，防止未经授权的人员接触，直至在目的地交还旅客或移交给另一承运人。
参考资料来源：南方航空官网-特殊行李-小动物
《中国民用航空旅客行李国内运输规则》第四十四条规定： 小动物是指家庭饲养的猫、狗其其它小动物。小动物运输，应按下列规定办理： 旅客必须在定座或购票时提出，并提供动物检疫证明，经承运人同意后方可托运。旅客应在乘机的当日，接承运人指定的时间，将小动物自行运到机场办理托运手续。 装运小动物的容器应符合下列要求： 1、能防止小动物破坏、逃逸和伸出容器以外损伤旅客、行李或货物。 2、保证空气流通，不致使小动物窒息。 3、能防止粪便渗溢，以免污染飞机、机上设备及其他物品。 旅客携带的小动物，除经承运人特许外，一律不能放在客舱内运输。 动物及其容器的重量应按逾重行李费的标准单独收费 具体手续： 1、办检疫证明： 到检疫局办理，很多宠物店可以帮你搞定，费用差不了多少 2、买一个航空箱： 宠物店一般都有宠物专用航空箱，几十到几百不等； 我也见过用塑料杂物箱/周转箱装宠物托运的，估计就看机场货运是否允许； 箱内要准备饮水器，尿不湿等 宠物旅行箱。尺寸有多种，你要问清楚航空公司要求的尺寸。 旅行用水瓶，悬挂于旅行箱内。宠物用舌头舔水管水才会出来。 宠物身份牌，买不到可自制。应用中、外文两种文字标明。 3、托运前准备： 订票前最好确认所乘航班飞机是否允许带宠物，也就是是否有活体动物货舱，一般都有； 提前一天向所乘航空公司货运部电话订舱，电话请向机场问讯或黄页查询； 如果你的宠物晕车、飞机，你需要事先咨询医生并准备相应的药品； 航空箱内准备少量的食物，可在箱内放置一些宠物喜欢的玩具以减少宠物的不安； 即使是不晕车的宠物，建议在上飞机前至少3小时禁食，登机前排尿，以减少在高空旅行时胃部的不适和负担。 如果你的宠物没有使用过饮水器，训练它使用。 4、托运 提前三个小时到机场办理宠物托运手续，具体地点咨询机场地面服务人员； 你还可以委托航空货运公司办理，费用可能低些，但是要提前更多时间去办理； 有些以卖狗为主的宠物店也可以全程代办宠物托运手续，他们异地交易就是这样交货的。 5、费用 全额票价的1.5％/公斤，例如全额票价1000元，宠物10公斤，那么运费为：1000×1.5%X10=150元。 6、取货 到港后至少一个小时后到机场货运处取货，货运处可能还会收取5元的手续费。 7、取货后 你的宠物在飞机上度过了新鲜、刺激、恐惧、孤独、不安的几个小时，所以你见到它首先一定要安抚，还有长时间坐飞机，容易渴，一定要给水喝。
宠物托运需要提前3天向航空公司申请，并主动出示检疫证明，经航空公司同意才能乘行。（注意，不是所有的航空公司都运送宠物的）在申请时会查询所乘航班是否是有氧舱，确认是有氧仓后会受理申请。
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