一根玉米棒上有不同颜色的玉米粒，这种玉米称之为彩色玉米。它是育种专家通过常规杂交育种方法将更多玉米的优良性状聚合在一起，鲜食玉米籽粒颜色分为黄、红、紫、白和双色，而颜色是受其自身类胡萝卜素和花青素影响，不是转基因所致。
彩色玉米是把从国外引进的彩色玉米品种经过不断培育筛选，‘改造’成适合在国内种植的稳定品种，一般需要7代才能成功。玉米是异花授粉植物，雄花和雌穗不长在同一部位。科研人员把黑色、紫色、黄色、白色等不同颜色玉米品种的雄花花粉混合在一起授给某一雌穗，就会得到第一代颜色混杂的‘杂种’玉米。如果想培育除黑紫相间的玉米，就选择颜色相对好的目标个体进行连续多代自交，后代会出现各种分离，经过6-7代坚持不懈地自交选择，才会获得相对稳定的彩色玉米材料，最后通过‘父亲’和‘母亲’的组配，得到黑紫玉米杂交种供生产应用。
在玉米杨花的时候，用专业术语来说就是会传粉的时候，由于一颗玉米旁边有不同颜色的玉米，在传粉过程中，几颗玉米的花粉都传到了一颗雌玉米的柱头上，这样雌花粉与不同颜色的花粉结合，所以啦，在一根玉米棒上会出现不同颜色的玉米粒！
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