寄居在人类体表和体内的微生物可分为三类:①正常菌群,指定居在人类皮肤及黏膜上的各类非致病微生物,非但无害,而且具有拮抗某些病原微生物和提供某些营养物的作用。②条件致病性微生物,原属正常菌群中的细菌,不会引起疾病,由于机体抵抗力下降,微生物寄居部位改变或菌群失调,此时该菌可致病。临床上多引起内源性感染。近年来由于大量广谱抗生素和免疫抑制剂的使用,这些条件致病菌越来越显示其致病作用。③病原微生物是少数可引起人类和动、植物致病的微生物,影响人类健康与生命,是医学微生物中要研究的主体。