A、生物进化的基本单位和生物繁殖的基本单位是种群，A错误．
B、自然选择通过作用于个体，对变异所对应的基因的选择，因而可以改变种群的基因频率，进而决定生物进化的方向，B错误．
C、基因频率发生改变，生物即发生进化，但不是形成新物种，物种形成的标志是物种隔离，C正确．
D、新物种的形成需要产生生殖隔离，一般通过长期的地理隔离达到生殖隔离，但人工创造新物种-通过植物体细胞杂交（如番茄-马铃薯）、多倍体远源杂交（如甘蔗-萝卜）、多倍体育种（如八倍体小黑麦）等方式也可以创造新物种，没有经过地理隔离；D错误．
故选：C．
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