①Na2O2中钠离子与过氧根离子之间形成离子键，过氧根离子中氧原子之间形成共价键，含有离子键和共价键两种作用力，故①正确；
②SiO2是原子晶体，只存在共价键，故②错误；
③石墨是层状结构，层内碳原子之间形成共价键，层与层之间通过分子间作用力结合，故③正确；
④金刚石是原子晶体，只存在共价键，故④错误；
⑤氯化钠属于离子晶体，钠离子与氯离子之间形成离子键，中只存在离子键，故⑤错误；
⑥白磷属于分子晶体，白磷分子中磷原子之间形成共价键，分子间存在分子间作用力，故⑥正确．
故选：D．
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