是的！Z40次和Z41次是同一趟列车，就是从上海开往乌鲁木齐南的同一班次、同一方向的一趟直达特快列车。铁路部门一趟列车有两个以及两个以上车次的，称之为“复车次”，这是因为这趟列车的运行线路的上行、下行方向发生了变化。
每条铁路有两个方向，分别为上行和下行方向。确定上、下行的一般原则是：朝向北京为上行方向，离开北京为下行方向；支线铁路朝向干线铁路为上行方向，远离干线铁路为下行方向。列车行驶为线路的上行方向时，一般为偶数车次；行驶为线路的下行方向时，一般为奇数车次。
z40z41是同一趟列车，列车时刻表见下图：
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