保证金在正常交易没有发生任何违规和纠纷售后的情况下是不会被扣除的。只有卖家在交易过程中,违法国家法规或者淘宝规则,或者是未履行消保服务、以及签约的特色服务承诺服务时,淘宝官方介入处理,才会先行从保证金中扣除相应资金。当售后结束后,系统会提示补缴扣除部分的保证金。如果卖家不及时补齐保证金,店铺宝贝,或者店铺将会受到处罚、下架、屏蔽、删除、甚至封店。